Siêu Điệp Viên 4: Người Kế Thừa Bourne đưa khán giả quay trở lại với thế giới đen tối và đầy phấn khích của Jason Bourne, nhưng lần này, câu chuyện tập trung vào Aaron Cross, một điệp viên giỏi được huấn luyện bởi chương trình bí mật của CIA. Trong khi Jason Bourne đã đưa các bí mật về Treadstone và Black Briar ra ánh sáng, thế giới ngầm khét tiếng Black Briar phải đối mặt với một mối đe dọa mới: một phóng viên Anh đang chuẩn bị công bố những hoạt động bí mật của họ. Kế hoạch khẩn cấp được thực hiện để loại bỏ mọi thông tin nhạy cảm, bao gồm cả việc xóa sổ tất cả các điệp viên tham gia, như Aaron Cross. Song, Aaron Cross đã thành công trong việc trốn thoát. Ông tìm kiếm Tiến sĩ Marta Shearing, người đã từng huấn luyện ông, trong một nỗ lực tìm kiếm lời giải đáp và cách dừng lại cơn ác mộng đã ám ảnh anh.

Nỗi đau và sự chết chóc lan tràn khi Aaron Cross cố gắng sống sót trong khi những thế lực tối tăm tận tâm muốn ám sát ông. Cùng với Tiến sĩ Shearing, Aaron Cross thỏa hiệp với toàn bộ ký ức sai khiến và những khía cạnh tiềm ẩn của quá khứ. Chuyến phiêu lưu đưa họ đến Manila, nơi họ phải chống lại những kẻ đuổi bắt, đồng thời đối mặt với những bí mật đau thương về chương trình OperaçãoOutcome. Tất cả muộn màng cũng nối tiếp nhau cùng một cách đều đầy nguy hiểm trong Siêu Điệp Viên 4: Người Kế Thừa Bourne, khi Aaron Cross phải từ bỏ mọi thứ để tìm kiếm sự thật và giành lấy cơ hội trốn thoát khỏi bóng ma của quá khứ.