Star Trek: Bộ Phận 31 là khởi nguồn của全新 câu chuyện trong Vũ trụ Star Trek, xoay quanh nhân vật Hoàng đế Philippa Georgiou, một nhân vật đã được giới thiệu trong tập phim Star Trek: Discovery. Sau khi trải qua nhiều biến hóa và sự điên đảo trong Thế giới của Star Trek, Ngài quyết định gia nhập Section 31, một đơn vị bí mật của Starfleet được lập ra để bảo vệ Liên bang các hành tinh khỏi những mối nguy hiểm tiềm ẩn. Section 31 hoạt động bên lề, thường xuyên phải thực hiện các nhiệm vụ ương mật và tàn bạo, dã tâm về bảo vệ Liên bang các hành tinh, đôi khi đi ngược lại với các nguyên tắc và đạo đức của Starfleet.

Trong Star Trek: Bộ Phận 31, Hoàng đế Georgiou phải đối mặt với những bóng ma trong quá khứ khi những tội lỗi mà Ngài đã gây ra trong quá trình đảm nhận vai trò Hoàng đế được đào bới. Ngài phải cân nhắc giữa việc hoàn thành nhiệm vụ và giữ gìn lòng lương tri của mình. Mặt khác, Section 31 cũng đối mặt với những thử thách mới từ những kẻ thù vô cùng nguy hiểm, đe dọa an ninh của整个 Liên bang các hành tinh.

Cùng với Hoàng đế Georgiou, dàn nhân vật mới đầy bí ẩn cũng xuất hiện trong bộ phim, mỗi người mang theo những mục đích và bí mật riêng. Họ sẽ cùng nhau đối mặt với những kẻ thù đáng gờm và những dilemmma đạo đức phức tạp, trong một cuộc hành trình đầy rẫy hiểm nguy và những bí mật chưa từng hé lộ. Star Trek: Bộ Phận 31 hứa hẹn sẽ mang đến những phút giây hồi hộp, đầy hấp dẫn và thách thức suy nghĩ cho khán giả.